
Samurai Evolution se déroule dans une version futuriste et étrange du Japon, où des samouraïs bioniques s'affrontent en duel et où les cerisiers ont été modifiés génétiquement pour servir de superordinateurs. Environ quinze ans auparavant, un contact a été établi avec le "Tenkai", ou royaume céleste – une civilisation extraterrestre cachée dont les habitants et la faune ressemblent fortement aux créatures des mythes et légendes terrestres. Après une brève guerre, les choses ont pris une tournure inattendue. Durant l'ère de paix qui a suivi, le Japon a été transformé en Oukoku, le "Royaume des Fleurs de Cerisier", et le Duel Astral est devenu une obsession nationale.